Kako bi bio prihvatljiv, projektni prijedlog mora udovoljavati svim utvrđenim kriterijima prihvatljivosti navedenim u poglavlju 2.6. Prihvatljivost projekta.

Prijavitelj mora biti registriran za  prihvatljive djelatnosti (sektore) u kojima će se odvijati projektne aktivnosti. Aktivnosti i troškovi projekta nisu prihvatljivi ukoliko su povezani uz sektore navedene u UzP-u poglavlju 2.6. Prihvatljivost projekta.

Kada je poduzetnik aktivan u jednom ili više neprihvatljivih sektora ili djelatnosti navedenih u odjeljcima 2.1 Prihvatljivost prijavitelja, 2.3. Kriteriji za isključenje prijavitelja i 2.6 Prihvatljivost projekta, a ima i druge djelatnosti koje su obuhvaćene područjem primjene Programa potpora male vrijednosti, može ostvariti pravo na potporu dodijeljenu u odnosu na potonje sektore ili djelatnosti, uz uvjet da sektori ili aktivnosti isključeni iz djelokruga Programa potpora male vrijednosti i ovih Uputa ne ostvaruju korist od potpore dodijeljene u okviru ovog Poziva. U tom pogledu korisnik potpore dužan je osigurati navedeno razdvajanje prihvatljivih od neprihvatljivih sektora bilo podjelom aktivnosti ili razdvajanjem troškova.

Razdvajanje djelatnosti podrazumijeva da dvije različite djelatnosti (na razini četveroznamenkaste NKD oznake) obavljaju različiti subjekti, dok razdvajanje troškova podrazumijeva razdvajanje računovodstva za dvije različite djelatnosti unutar istog poslovnog subjekta za vrijeme trajanja projekta i tri godine nakon isteka razdoblja provedbe projekta. Nastavno na pravilo navedeno u poglavlju 2.3 Kriteriji za isključenje prijavitelja UzP-a, razdvajanje sektora i troškova nije moguće prema djelatnostima na razini jednog projekta te je odgovornost prijavitelja da vodi računa za koju od registriranih djelatnosti prijavljuje projekt.

Bez uvida u konkretnu prijavu, a u interesu jednakog postupanja, nadležno tijelo ne može dati prethodno mišljenje u svezi s prihvatljivošću prijavitelja, projekta ili određenih aktivnosti i troškova te ne može zamijeniti niti prejudicirati ishod pojedinih faza postupka dodjele kako su opisane u UzP-u. Slijedom navedenog, nadležno tijelo nije u mogućnosti odgovarati na pitanja koja zahtijevaju ocjenu prihvatljivosti konkretnog projekta, konkretnog prijavitelja, konkretnih aktivnosti, konkretnih troškova i slično.