Neizravni troškovi nastali izravno kao posljedica provedbe istraživačkog projekta kod prijavitelja izračunavaju se po fiksnoj stopi do visine od 7% iznosa ukupne vrijednosti prihvatljivih troškova projekta. U Uputama za prijavitelje nije izrijekom navedeno da poslovni subjekti moraju dostaviti dokaze o povećanim režijskim troškovima, no moguće je naknadno tražiti iste, kako je navedeno u poglavlju UzP „Provjere upravljanja projektom“.