Prihvatljivi troškovi navedeni su u poglavlju 2.10. „Prihvatljive kategorije troškova“ UzP-a. Sukladno navedenom poglavlju, prihvatljivi su troškovi nabave instrumenata i opreme neophodne za provedbu projekta. Isto tako, neprihvatljivi su svi troškovi koji ne spadaju u aktivnosti navedene u odjeljku „Prihvatljive kategorije troškova“. U skladu s predmetnim Pozivom, nabava instrumenata i opreme te s njima povezani troškovi aktiviranja, transporta, montaže i stavljanja u pogon, prihvatljivi su troškovi isključivo ako ih u pogon stavlja dobavljač, odnosno ukoliko su prikazani na istom računu s nabavljenom opremom te predstavljaju sastavni dio nabave opreme.